一种同步检测CRISPR脱靶位点与病毒载体整合位点的体内检测方法
申请号:CN202510822496
申请日期:2025-06-19
公开号:CN120775967A
公开日期:2025-10-14
类型:发明专利
摘要
本发明涉及分子生物学、核酸检测与生物信息学交叉技术领域,公开了一种同步检测CRISPR脱靶位点与病毒载体整合位点的体内检测方法。本发明提供的一种同步检测CRISPR脱靶位点与病毒载体整合位点的体内检测方法首次将AAV载体自身的反向末端重复序列(ITR)用作标签序列,通过设计通用的PCR扩增引物和引入唯一分子标识符(UMI)技术,同时捕捉和精准识别体内CRISPR编辑过程中的脱靶事件和AAV载体整合事件。本发明提供的一种同步检测CRISPR脱靶位点与病毒载体整合位点的体内检测方法相较现有GUIDE‑seq、DISCOVER‑Seq+、OliTag‑seq、U‑DiTaS等方案,在体内适用性、检测深度、操作经济性和产业化标准化方面均实现了显著突破。
技术关键词
脱靶位点
病毒载体
高通量测序平台
序列比对算法
体内检测系统
测序接头
序列特征
重复序列
长读长测序
编辑
可视化图表
索引策略
高效算法
分析模块
报告
数据