一种可高效应用于SNP芯片、低覆盖率基因组测序及转录组测序等数据的基因型插补方法

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一种可高效应用于SNP芯片、低覆盖率基因组测序及转录组测序等数据的基因型插补方法
申请号:CN202411693247
申请日期:2024-11-25
公开号:CN119851758A
公开日期:2025-04-18
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种可高效应用于SNP芯片、低覆盖率基因组测序及转录组测序等数据的基因型插补方法包括,构建插补数据平台,捕获测序数据处理及SNP,进行芯片数据处理及RNA‑Seq数据处理;确定插补准确性指标,构建定相和插补的软件组合,进行全基因组关联分析;输出分析结果。本方法考虑到不同数据类型的独有特点和动物的亲缘关系。通过本方法,可以更精确地插补三种数据类型,从而为科研和育种提供更为可靠的科学依据。
技术关键词
转录组测序 插补方法 全基因组关联分析 覆盖率 基因组低深度测序 Pearson相关系数 芯片 数据平台 cDNA文库 分光光度计 效应 软件 处理器 计算机设备 指标 可读存储介质 校准 染色体