一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用

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一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用
申请号:CN202411639239
申请日期:2024-11-18
公开号:CN119144700B
公开日期:2025-11-07
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用。所述方法包括:进行组织透化处理,使用微球矩阵捕获芯片进行捕获,随后进行反转录和cDNA一链合成、cDNA二链合成,将微球矩阵捕获芯片进行分区,对每个区域解链以及cDNA扩增,对扩增产物进行纯化。本发明设计提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法,将芯片进行破碎分区或者使用杂交垫片设置分区进行检测,操作简单易行,并不需要直接提高条形码的种类,减少了扩大微球池时,合成微球引物的数量以及解码探针的种类,有效节省成本,另外也无需更多的解码轮次即可实现微球芯片的解码,能减少解码过程对捕获芯片的损伤,有效提高了大尺寸空间转录组芯片捕获的效率。
技术关键词
微球 转录组测序 捕获面积 芯片 矩阵 缓冲液 分区法 胃蛋白酶 文库 DNA聚合酶 磁珠 解码 捕获探针 垫片 组织切片 引物 染色